Solr Queries

Relations

Production Query

Dev Query

relation count
Total 25093829 (-17346545)
has phenotype 4494554 (-649296)
interacts with 2977954 (-645930)
in paralogy relationship with 2931576 (+144646)
in 1 to 1 orthology relationship with 2552924 (+563314)
Other 2343311 (-2548203)
in orthology relationship with 2108290 (+396862)
expressed in 1862538 (+4067)
involved_in 1550334 (+446579)
is_allele_of 839883 (-181809)
Source 701806 (-1892456)
is part of 470222 (+113407)
enables 416639 (+97969)
has_affected_feature 406100 (+248348)
has_genotype 402992 (-344819)
in xenology relationship with 289220 (-4013)
contributes to condition 192788 (+161718)
is marker for 140585 (+546)
targets_gene 64880 (-110613)
is_expression_variant_of 60893 (-110375)
pathogenic_for_condition 58825 (+3528)
is_reference_allele_of 58320 (+183)
is_about 39698 (-8121930)
is model of 37659 (-78)
derives_from 29852 (+45)
mentions 22986 (-4667707)
likely_pathogenic_for_condition 19396 (+722)
causes condition 10537 (-297)
sequence_derives_from 8502 (-141626)
is causal susceptibility factor for 430 (+430)
contributes to 79 (-272)
disease has basis in feature 54 (+1)
is_variant_allele_of 2 (0)
colocalizes with 0 (-83256)
genetically interacts with 0 (-26230)

Gene Variant Associations

Production Query

Dev Query

species count
Total 1438580 (-295892)
Mus musculus 861071 (+35250)
Homo sapiens 220392 (+49871)
Drosophila melanogaster 181505 (-288902)
Caenorhabditis elegans 114726 (-1427)
Danio rerio 25882 (-11756)
Bos taurus 16962 (-62)
organism 7104 (+3247)
Sus scrofa 3353 (-27)
Gallus gallus 1687 (-25)
Drosophila ananassae 601 (-10)
Drosophila virilis 571 (-6)
Drosophila subobscura 536 (0)
Drosophila hydei 523 (-15)
Drosophila simulans 433 (-6)
Drosophila pseudoobscura pseudoobscura 330 (0)
Equus caballus 235 (-4)
Drosophila willistoni 206 (0)
Rattus norvegicus 180 (-76)
Drosophila funebris 177 (-2)
NCBITaxon:40372 149 (0)
NCBITaxon:30033 123 (0)
Drosophila mauritiana 122 (0)
NCBITaxon:7257 122 (0)
Drosophila buzzatii 121 (-2)
NCBITaxon:95109 95 (0)
Drosophila immigrans 91 (0)
Drosophila miranda 88 (0)
NCBITaxon:30019 88 (0)
NCBITaxon:7246 58 (0)
NCBITaxon:7300 53 (0)
NCBITaxon:76712 52 (0)
NCBITaxon:7231 50 (0)
Drosophila mojavensis 44 (0)
Drosophila affinidisjuncta 42 (0)
Drosophila teissieri 41 (0)
Drosophila persimilis 39 (0)
NCBITaxon:30042 39 (0)
Drosophila littoralis 35 (0)
Drosophila paulistorum 32 (0)
Drosophila takahashii 30 (0)
Drosophila lutescens 27 (0)
Drosophila arizonae 26 (0)
NCBITaxon:7218 26 (0)
Escherichia coli 24 (-14313)
NCBITaxon:60717 24 (0)
NCBITaxon:111875 24 (0)
Hepacivirus C 22 (+22)
Drosophila ambigua 19 (0)
NCBITaxon:7283 18 (0)
NCBITaxon:42026 18 (0)
NCBITaxon:193351 17 (0)
Hepatitis C virus subtype 2a 15 (+15)
Drosophila auraria 14 (0)
NCBITaxon:7282 14 (0)
NCBITaxon:125945 14 (0)
Drosophila sechellia 13 (0)
HIV-1 M:C_ETH2220 13 (+13)
NCBITaxon:64960 12 (0)
Drosophila hawaiiensis 12 (0)
Escherichia coli K-12 11 (+11)
Drosophila yakuba 9 (0)
NCBITaxon:30036 9 (0)
NCBITaxon:195057 8 (0)
HIV-1 M:B_HXB2R 8 (+8)
NCBITaxon:47314 8 (0)
NCBITaxon:161732 8 (0)
Simian virus 40 8 (+8)
Scaptodrosophila lebanonensis 7 (+1)
Sindbis virus 7 (+5)
Ovis aries 7 (-4)
Drosophila grimshawi 6 (0)
NCBITaxon:7291 6 (0)
NCBITaxon:30043 6 (0)
NCBITaxon:46794 6 (0)
NCBITaxon:94111 6 (0)
Human T-cell lymphotrophic virus type 1 (strain ATK) 5 (+5)
NCBITaxon:76946 5 (0)
NCBITaxon:103846 5 (0)
NCBITaxon:77771 5 (+5)
Human immunodeficiency virus 1 4 (-2)
Canis lupus familiaris 4 (-4)
NCBITaxon:169138 4 (0)
Drosophila eugracilis 4 (0)
Hepatitis B virus 4 (+4)
NCBITaxon:30023 4 (0)
NCBITaxon:69217 3 (0)
NCBITaxon:7249 3 (0)
Candida albicans 3 (+3)
Staphylococcus epidermidis 3 (+3)
NCBITaxon:218680 3 (0)
Human papillomavirus type 16 3 (+3)
Pan troglodytes 2 (0)
Drosophila erecta 2 (0)
Dengue virus group 2 (+2)
NCBITaxon:46822 2 (0)
NCBITaxon:7279 2 (0)
Xenopus (Silurana) tropicalis 2 (0)
NCBITaxon:40844 2 (0)
NCBITaxon:7297 2 (0)
[Candida] glabrata 2 (+2)
Salmonella 2 (+2)
NCBITaxon:42062 2 (0)
NCBITaxon:57910 2 (0)
Drosophila equinoxialis 2 (0)
Drosophila pseudoobscura bogotana 2 (0)
NCBITaxon:30028 2 (0)
Drosophila madeirensis 2 (0)
NCBITaxon:30056 2 (0)
Bacillus megaterium 1 (+1)
NCBITaxon:310057 1 (0)
Saccharomyces cerevisiae S288C 1 (0)
NCBITaxon:133978 1 (0)
NCBITaxon:7270 1 (0)
Drosophila borealis 1 (0)
NCBITaxon:133981 1 (0)
NCBITaxon:134002 1 (0)
NCBITaxon:7252 1 (0)
Drosophila orena 1 (0)
NCBITaxon:30029 1 (0)
Murine leukemia virus 1 (+1)
NCBITaxon:141217 1 (0)
NCBITaxon:66368 1 (0)
NCBITaxon:1392869 1 (+1)
Pseudomonas aeruginosa 1 (0)
NCBITaxon:7248 1 (0)
NCBITaxon:521007 1 (+1)
Arabidopsis thaliana 1 (-7)
NCBITaxon:198721 1 (0)
NCBITaxon:7271 1 (0)
Staphylococcus aureus subsp. aureus 1 (+1)
NCBITaxon:7284 1 (0)
Yellow fever virus 1 (+1)
Artemia franciscana 0 (-6)
Anopheles funestus 0 (-4)
NCBITaxon:2138 0 (-3)
Human T-lymphotropic virus 2 0 (-1)
Enterobacteria phage T7 0 (-9)
Bombyx mori 0 (-18)
BNODE:b1a448feb24de46088b 0 (-1)
Ixodes scapularis 0 (-1)
Photinus pyralis 0 (-143)
Culex pipiens 0 (-3)
NCBITaxon:7010 0 (-4)
NCBITaxon:86600 0 (-349)
Rhodococcus sp. 0 (-4)
Ceratitis capitata 0 (-5)
NCBITaxon:38358 0 (-6)
Autographa californica nucleopolyhedrovirus 0 (-14)
BNODE:1f58a0779e93c2ed4d2 0 (-1)
NCBITaxon:4808 0 (-1)
NCBITaxon:2389 0 (-15)
Pediculus humanus 0 (-1)
Escherichia virus P1 0 (-17)
NCBITaxon:118641 0 (-1)
Bacillus anthracis 0 (-3)
Aequorea victoria 0 (-3561)
Bordetella pertussis 0 (-5)
BNODE:a35efa09e0fb254e16a 0 (-14)
NCBITaxon:62873 0 (-2)
Rhodopseudomonas palustris 0 (-2)
NCBITaxon:12232 0 (-1)
NCBITaxon:6136 0 (-6)
BNODE:e3f956b320a9fec1cf3 0 (-1)
Acyrthosiphon pisum 0 (-2)
Neurospora crassa 0 (-94)
Deinococcus radiodurans 0 (-2)
NCBITaxon:10456 0 (-1)
Bradyrhizobium sp. 0 (-7)
Conus marmoreus 0 (-1)
Musca domestica 0 (-13)
NCBITaxon:1962953 0 (-1)
NCBITaxon:1162220 0 (-1)
BNODE:13446b3196cf19c664c 0 (-5)
Trichoplax adhaerens 0 (-2)
NCBITaxon:7120 0 (-1)
Chlamydomonas reinhardtii 0 (-47)
NCBITaxon:3821 0 (-1)
Entacmaea quadricolor 0 (-21)
Cricetulus griseus 0 (-1)
Limulus polyphemus 0 (-2)
Schistosoma japonicum 0 (-2)
Staphylococcus aureus 0 (-3)
Bacillus subtilis 0 (-3)
NCBITaxon:148603 0 (-6)
Penaeus merguiensis 0 (-1)
NCBITaxon:7007 0 (-1)
NCBITaxon:1208342 0 (-2)
Human betaherpesvirus 5 0 (-2)
NCBITaxon:1649241 0 (-1)
Human papillomavirus type 18 0 (-2)
Tribolium castaneum 0 (-24)
Human alphaherpesvirus 1 0 (-43)
NCBITaxon:45264 0 (-2)
Streptomyces hygroscopicus 0 (-1)
NCBITaxon:28456 0 (-4)
NCBITaxon:196280 0 (-3)
Cricket paralysis virus 0 (-2)
NCBITaxon:12227 0 (-11)
Bacillus halodurans 0 (-2)
Campoletis sonorensis ichnovirus 0 (-2)
NCBITaxon:7038 0 (-2)
Enterococcus faecalis 0 (-1)
Natronomonas pharaonis 0 (-7)
NCBITaxon:35525 0 (-2)
Kluyveromyces lactis 0 (-7)
Brevundimonas diminuta 0 (-1)
Hadronyche versuta 0 (-2)
Arachis hypogaea 0 (-1)
NCBITaxon:2387 0 (-13)
Human T-cell leukemia virus type I 0 (-1)
Helicobacter pylori 0 (-2)
Spodoptera frugiperda ascovirus 1a 0 (-3)
Heliothis virescens 0 (-3)
NCBITaxon:12470 0 (-12)
Armoracia rusticana 0 (-1)
Mesocricetus auratus 0 (-5)
Aedes aegypti 0 (-8)
NCBITaxon:2014434 0 (-1)
Apis mellifera 0 (-13)
NCBITaxon:56459 0 (-1)
Amphimedon queenslandica 0 (-2)
NCBITaxon:418985 0 (-3)
Corynephage beta 0 (-13)
NCBITaxon:11309 0 (-3)
Rhodobacter sphaeroides 0 (-1)
Streptococcus pyogenes 0 (-27)
Tomato bushy stunt virus 0 (-4)
NCBITaxon:496660 0 (-4)
Human adenovirus 5 0 (-5)
Triticum aestivum 0 (-2)
Lucilia cuprina 0 (-3)
Zygosaccharomyces rouxii 0 (-4)
NCBITaxon:161601 0 (-1)
Xenopus laevis 0 (-33)
BNODE:fc3f087ca372cb4d3a9 0 (-14)
Ricinus communis 0 (-7)
Megaselia scalaris 0 (-1)
Manduca sexta 0 (-1)
NCBITaxon:7111 0 (-8)
Guillardia theta 0 (-4)
Providencia stuartii 0 (-2)
NCBITaxon:95512 0 (-4)
Anopheles gambiae 0 (-80)
BNODE:f8141fdf82ae439afe6 0 (-3)
Hemitripterus americanus 0 (-1)
Vaccinia virus 0 (-1)
Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium 0 (-6)
BNODE:bb2cf0ff025d4622cf5 0 (-16)
Monosiga brevicollis 0 (-3)
NCBITaxon:491304 0 (-1)
NCBITaxon:32630 0 (-197)
Human mastadenovirus C 0 (-5)
NCBITaxon:8204 0 (-5)
NCBITaxon:46745 0 (-1)
Oryctolagus cuniculus 0 (-11)
NCBITaxon:109461 0 (-2)
Pseudopleuronectes americanus 0 (-3)
Clostridium tetani 0 (-19)
Bungarus multicinctus 0 (-2)
Listeria monocytogenes 0 (-5)
Nodamura virus 0 (-1)
Turnip crinkle virus 0 (-1)
NCBITaxon:80765 0 (-3)
NCBITaxon:55100 0 (-3)
BNODE:eaba42a506034628afd 0 (-3)
Halocynthia roretzi 0 (-1)
NCBITaxon:499226 0 (-1)
NCBITaxon:11913 0 (-1)
BNODE:e66d689dd86a07aea60 0 (-3)
Glossina morsitans 0 (-3)
Toxoplasma gondii 0 (-3)
NCBITaxon:7740 0 (-4)
NCBITaxon:82678 0 (-2)
Potato virus X 0 (-1)
NCBITaxon:88209 0 (-2)
Zygosaccharomyces bailii 0 (-3)
NCBITaxon:55084 0 (-1)
Beet yellows virus 0 (-1)
Cucurbit aphid-borne yellows virus 0 (-1)
Heteractis crispa 0 (-2)
NCBITaxon:5530 0 (-2)
NCBITaxon:32644 0 (-57)
NCBITaxon:32392 0 (-1)
NCBITaxon:4957 0 (-3)
NCBITaxon:35743 0 (-1)
NCBITaxon:46758 0 (-8)
NCBITaxon:1051066 0 (-1)
Vibrio parahaemolyticus 0 (-3)
Cupiennius salei 0 (-8)
Other 0 (0)
NCBITaxon:45455 0 (-4)
Vibrio cholerae 0 (-3)
Ciona intestinalis 0 (-4)
Clavularia sp. 0 (-2)
Glycine max 0 (-2)
Euglena gracilis 0 (-3)
NCBITaxon:108931 0 (-2)
Drosophila C virus 0 (-4)
NCBITaxon:51655 0 (-1)
Blattella germanica 0 (-2)
Aeromonas salmonicida 0 (-2)
NCBITaxon:703 0 (-1)
NCBITaxon:191210 0 (-2)
Escherichia virus Lambda 0 (-2)
NCBITaxon:7119 0 (-2)
NCBITaxon:35572 0 (-1)
Saccharomyces cerevisiae 0 (-26882)
Mus musculus domesticus 0 (-35507)
NCBITaxon:39722 0 (-1)
NCBITaxon:955 0 (-5)
NCBITaxon:12022 0 (-4)
NCBITaxon:301887 0 (-1)
Schistocerca americana 0 (-2)
NCBITaxon:139456 0 (-1)
Danaus plexippus 0 (-6)
Peanut clump virus 0 (-1)
Oryza sativa 0 (-2)
Hydra vulgaris 0 (-3)
NCBITaxon:12287 0 (-8)
NCBITaxon:658227 0 (-24)
Macaca mulatta polyomavirus 1 0 (-5)
NCBITaxon:191766 0 (-1)

Model Disease Associations

Production Query

Dev Query

species count
Total 26368 (-100)
Homo sapiens 12010 (+30)
Mus musculus 7829 (+631)
Caenorhabditis elegans 3306 (+269)
Drosophila melanogaster 1207 (-594)
Other 831 (+829)
Carnivora 684 (0)
organism 185 (+88)
Ruminantia 144 (0)
Felidae 55 (0)
Danio rerio 43 (-865)
Equidae 34 (0)
sequence_alteration 18 (+18)
Sus 5 (0)
Suidae 5 (0)
Bos taurus 3 (0)
Gallus gallus 3 (0)
NCBITaxon:477815 2 (0)
Bovidae 2 (0)
Mus musculus castaneus 1 (0)
Viridiplantae 1 (0)
Mus musculus domesticus 0 (-504)
Mus musculus musculus 0 (-2)

Disease Phenotype Associations

Production Query

Dev Query

species count
Total 155625 (+9605)
Other 145184 (-820)
Homo sapiens 10441 (+10425)

Variant Disease Associations

Production Query

Dev Query

species count
Total 112866 (+8233)
Homo sapiens 112093 (+8271)
organism 735 (-38)
Mus musculus 37 (+16)
Bos taurus 1 (0)
Other 0 (0)
Mus musculus domesticus 0 (-16)

Variant Genotype Associations

Production Query

Dev Query

species count
Total 665213 (-1020356)
Mus musculus 652284 (+6333)
organism 7091 (-37)
Homo sapiens 4528 (+3)
sequence_alteration 1235 (+1235)
NCBITaxon:10102 20 (0)
Mus musculus molossinus 15 (0)
Mus musculus bactrianus 7 (0)
Mus spretus 6 (0)
Mus musculus musculus 5 (-6)
Danio rerio 4 (-153358)
Mus musculus castaneus 4 (0)
Mus 4 (0)
Rattus norvegicus 4 (0)
Macaca mulatta 2 (0)
Plecturocebus moloch 1 (0)
Cricetulus griseus 1 (0)
Bos taurus 1 (0)
Saguinus labiatus 1 (0)
Other 0 (0)
Drosophila melanogaster 0 (-873495)
Mus musculus domesticus 0 (-1031)

Genotype Phenotype Associations

Production Query

Dev Query

species count
Total 456032 (-505080)
Mus musculus 358530 (+5684)
Homo sapiens 75404 (+1000)
organism 19870 (+2819)
sequence_alteration 1520 (+1520)
Danio rerio 653 (-101276)
Mus musculus molossinus 13 (0)
NCBITaxon:477815 12 (0)
Mus musculus castaneus 12 (0)
NCBITaxon:10102 8 (0)
Mus 4 (0)
Mus musculus musculus 3 (-11)
Mus spretus 2 (0)
Mus musculus bactrianus 1 (0)
Other 0 (0)
Drosophila melanogaster 0 (-412276)
Mus musculus domesticus 0 (-2540)

Gene Phenotype Associations

Production Query

Dev Query

species count
Total 655968 (-66745)
Mus musculus 212741 (+10903)
Homo sapiens 149519 (+18545)
Caenorhabditis elegans 77217 (+23354)
Drosophila melanogaster 69381 (-126694)
Saccharomyces cerevisiae S288C 68230 (0)
Danio rerio 62609 (+5940)
organism 11068 (+5009)
Canis lupus familiaris 476 (0)
Rattus norvegicus 468 (+7)
Drosophila hydei 468 (+468)
Drosophila subobscura 377 (+377)
Drosophila virilis 342 (+342)
Drosophila ananassae 270 (+270)
Drosophila simulans 208 (+208)
Drosophila pseudoobscura pseudoobscura 206 (+206)
Drosophila willistoni 194 (+194)
Bos taurus 163 (0)
NCBITaxon:7257 153 (+153)
Drosophila funebris 133 (+133)
Felis catus 132 (0)
NCBITaxon:30019 124 (+124)
NCBITaxon:40372 118 (+118)
NCBITaxon:30033 82 (+82)
NCBITaxon:95109 82 (+82)
Escherichia coli 76 (+76)
Drosophila immigrans 72 (+72)
NCBITaxon:7300 69 (+69)
NCBITaxon:7246 63 (+63)
Ovis aries 57 (0)
NCBITaxon:30042 56 (+56)
Drosophila buzzatii 55 (+55)
Drosophila mauritiana 52 (+52)
Drosophila paulistorum 49 (+49)
Drosophila miranda 43 (+43)
Drosophila littoralis 34 (+34)
NCBITaxon:7218 33 (+33)
Equus caballus 31 (0)
Sus scrofa 31 (0)
Drosophila ambigua 27 (+27)
NCBITaxon:193351 22 (+22)
Gallus gallus 19 (0)
Capra hircus 18 (0)
Hepatitis C virus subtype 2a 17 (+17)
Phoenicopterus ruber 17 (0)
NCBITaxon:125945 15 (+15)
Drosophila persimilis 14 (+14)
NCBITaxon:76712 14 (+14)
NCBITaxon:7282 13 (+13)
NCBITaxon:7283 13 (+13)
Drosophila mojavensis 12 (+12)
NCBITaxon:64960 11 (+11)
Drosophila auraria 11 (+11)
NCBITaxon:46794 10 (+10)
Mustela putorius furo 10 (0)
Oryctolagus cuniculus 10 (0)
Drosophila sechellia 9 (+9)
Sindbis virus 9 (+9)
HIV-1 M:B_HXB2R 9 (+9)
NCBITaxon:169138 7 (+7)
NCBITaxon:42026 7 (+7)
NCBITaxon:30043 7 (+7)
NCBITaxon:47314 6 (+6)
Escherichia coli K-12 6 (+6)
NCBITaxon:161732 6 (+6)
Hepacivirus C 6 (+6)
Simian virus 40 6 (+6)
Hepatitis B virus 5 (+5)
Macaca mulatta 4 (0)
NCBITaxon:69217 4 (+4)
NCBITaxon:46822 4 (+4)
NCBITaxon:40844 4 (+4)
HIV-1 M:C_ETH2220 4 (+4)
NCBITaxon:30028 4 (+4)
Oryzias latipes 4 (0)
Neovison vison 4 (0)
Human immunodeficiency virus 1 3 (+3)
Drosophila equinoxialis 3 (+3)
NCBITaxon:218680 3 (+3)
Candida albicans 3 (+3)
Drosophila pseudoobscura bogotana 3 (+3)
NCBITaxon:30036 3 (+3)
NCBITaxon:198721 3 (+3)
Meleagris gallopavo 3 (0)
Human T-cell lymphotrophic virus type 1 (strain ATK) 3 (+3)
NCBITaxon:7252 3 (+3)
Drosophila takahashii 3 (+3)
NCBITaxon:94111 3 (+3)
Mesocricetus auratus 3 (0)
Drosophila arizonae 2 (+2)
NCBITaxon:141217 2 (+2)
Drosophila erecta 2 (+2)
NCBITaxon:42062 2 (+2)
Scaptodrosophila lebanonensis 2 (+2)
NCBITaxon:7270 2 (+2)
NCBITaxon:133981 2 (+2)
Drosophila eugracilis 2 (+2)
NCBITaxon:195057 2 (+2)
Human papillomavirus type 16 2 (+2)
NCBITaxon:134002 2 (+2)
NCBITaxon:133978 2 (+2)
Bubalus bubalis 2 (0)
Drosophila madeirensis 2 (+2)
NCBITaxon:30023 2 (+2)
NCBITaxon:7291 2 (+2)
Staphylococcus epidermidis 2 (+2)
NCBITaxon:30029 2 (+2)
Vulpes vulpes 2 (0)
NCBITaxon:76946 2 (+2)
NCBITaxon:7271 2 (+2)
NCBITaxon:7297 1 (+1)
Drosophila lutescens 1 (+1)
Bacillus megaterium 1 (+1)
NCBITaxon:70340 1 (0)
NCBITaxon:38666 1 (0)
Peromyscus polionotus 1 (0)
NCBITaxon:310057 1 (+1)
NCBITaxon:57910 1 (+1)
NCBITaxon:9690 1 (0)
NCBITaxon:103846 1 (+1)
NCBITaxon:7231 1 (+1)
Yellow fever virus 1 (+1)
NCBITaxon:7279 1 (+1)
Panthera tigris tigris 1 (0)
NCBITaxon:1392869 1 (+1)
Ursus americanus 1 (0)
NCBITaxon:61402 1 (0)
Bos grunniens 1 (0)
Drosophila yakuba 1 (+1)
NCBITaxon:68352 1 (0)
Coturnix japonica 1 (0)
NCBITaxon:27706 1 (0)
NCBITaxon:521007 1 (+1)
NCBITaxon:87177 1 (0)
NCBITaxon:32536 1 (0)
Mammuthus primigenius 1 (0)
Sciurus carolinensis 1 (0)
Staphylococcus aureus subsp. aureus 1 (+1)
NCBITaxon:66368 1 (+1)
Numida meleagris 1 (0)
Vulpes lagopus 1 (0)
NCBITaxon:7284 1 (+1)
Salmonella 1 (+1)
Dengue virus group 1 (+1)
NCBITaxon:43597 1 (0)
NCBITaxon:30056 1 (+1)
Murine leukemia virus 1 (+1)
Other 0 (0)
Mus musculus domesticus 0 (-7540)

Gene Disease Associations

Production Query

Dev Query

species count
Total 44118 (+16491)
Homo sapiens 42931 (+16356)
Canis lupus familiaris 230 (-1)
Mus musculus 227 (+11)
Bos taurus 124 (0)
Felis catus 62 (0)
Ovis aries 47 (0)
Sus scrofa 43 (0)
Gallus gallus 43 (0)
Equus caballus 39 (0)
Rattus norvegicus 35 (+2)
Drosophila melanogaster 33 (-1)
Escherichia coli 27 (+27)
Danio rerio 24 (0)
Human immunodeficiency virus 1 20 (+20)
Capra hircus 15 (0)
Oryctolagus cuniculus 12 (0)
Coturnix japonica 9 (0)
Dengue virus group 8 (+8)
Hepatitis C virus subtype 2a 7 (+7)
Lactobacillus johnsonii NCC 533 7 (+7)
Candida albicans SC5314 6 (+6)
Neovison vison 5 (0)
Sindbis virus 5 (+5)
HIV-1 M:C_ETH2220 5 (+5)
Equus asinus 5 (0)
Simian virus 40 5 (+5)
NCBITaxon:521007 4 (+4)
Mesocricetus auratus 4 (0)
Bubalus bubalis 4 (0)
Human T-cell lymphotrophic virus type 1 (strain ATK) 4 (+4)
Caenorhabditis elegans 4 (0)
Staphylococcus epidermidis 4 (+4)
Vulpes lagopus 3 (0)
NCBITaxon:198806 3 (0)
Macaca mulatta 3 (0)
Candida albicans 3 (+3)
Bos grunniens 3 (0)
Hepacivirus C 3 (+3)
NCBITaxon:387139 3 (+3)
Oryzias latipes 3 (0)
Xenopus (Silurana) tropicalis 2 (+1)
Salmonella 2 (+2)
Mustela putorius furo 2 (0)
NCBITaxon:48883 2 (0)
Mammuthus primigenius 2 (0)
Escherichia coli K-12 2 (+2)
Hepatitis B virus 2 (+2)
Pseudomonas aeruginosa 2 (+2)
Escherichia coli UTI89 2 (+2)
[Candida] glabrata 2 (+2)
Meleagris gallopavo 2 (0)
Macaca fascicularis 2 (0)
HIV-1 M:B_HXB2R 2 (+2)
Vulpes vulpes 2 (0)
NCBITaxon:32536 2 (0)
NCBITaxon:87177 1 (0)
NCBITaxon:9579 1 (0)
Ctenopharyngodon idella 1 (0)
NCBITaxon:61406 1 (0)
NCBITaxon:118797 1 (0)
NCBITaxon:255217 1 (0)
NCBITaxon:37029 1 (0)
Delphinapterus leucas 1 (0)
Peromyscus polionotus 1 (0)
Pan troglodytes 1 (0)
NCBITaxon:54059 1 (0)
NCBITaxon:9691 1 (0)
NCBITaxon:9690 1 (0)
NCBITaxon:70340 1 (0)
Coturnix coturnix 1 (0)
Cebus apella 1 (0)
NCBITaxon:61455 1 (0)
NCBITaxon:38666 1 (0)
Yellow fever virus 1 (+1)
Canis latrans 1 (0)
Anas platyrhynchos 1 (0)
Panthera tigris tigris 1 (0)
Tursiops truncatus 1 (0)
Peromyscus maniculatus 1 (0)
Bos mutus 1 (0)
NCBITaxon:61402 1 (0)
Sus scrofa domesticus 1 (0)
NCBITaxon:1392869 1 (+1)
NCBITaxon:34892 1 (0)
NCBITaxon:68352 1 (0)
Takifugu rubripes 1 (0)
Gorilla gorilla 1 (0)
Ursus americanus 1 (0)
Columba livia 1 (0)
Hylobates lar 1 (0)
NCBITaxon:328808 1 (0)
NCBITaxon:57661 1 (0)
NCBITaxon:8523 1 (0)
Bacillus megaterium 1 (+1)
Dromaius novaehollandiae 1 (0)
Balaenoptera acutorostrata 1 (0)
Oreochromis niloticus 1 (0)
Aepyceros melampus 1 (0)
NCBITaxon:61386 1 (0)
Sciurus carolinensis 1 (0)
Phoenicopterus ruber 1 (0)
NCBITaxon:103584 1 (0)
NCBITaxon:57662 1 (0)
NCBITaxon:9773 1 (0)
Astyanax 1 (0)
Numida meleagris 1 (0)
Cavia porcellus 1 (0)
Rangifer tarandus 1 (0)
Camelus dromedarius 1 (0)
Panthera tigris 1 (0)
NCBITaxon:273489 1 (0)
NCBITaxon:120794 1 (0)
Canis lupus 1 (0)
NCBITaxon:43597 1 (0)
NCBITaxon:338458 1 (0)
NCBITaxon:46844 1 (0)
Symphalangus syndactylus 1 (0)
Elephas maximus 1 (0)
Macaca fuscata 1 (0)
NCBITaxon:345164 1 (0)
Human papillomavirus type 16 1 (+1)
Other 0 (0)
Mus musculus domesticus 0 (-6)

Variant Phenotype Associations

Production Query

Dev Query

species count
Total 3489778 (-21463)
Homo sapiens 2137928 (+252012)
Mus musculus 428643 (+73371)
organism 391314 (-240179)
Caenorhabditis elegans 195108 (+104047)
Drosophila melanogaster 146328 (-64463)
Bos taurus 125205 (+7)
Sus scrofa 34559 (0)
Gallus gallus 13529 (+190)
Danio rerio 8132 (-83923)
Ovis aries 1519 (+26)
sequence_alteration 1305 (+1305)
Equus caballus 1009 (+2)
Drosophila hydei 663 (+663)
Drosophila subobscura 602 (+602)
Drosophila virilis 600 (+600)
Drosophila ananassae 422 (+422)
Drosophila pseudoobscura pseudoobscura 324 (+324)
Drosophila simulans 283 (+283)
Drosophila willistoni 260 (+260)
Drosophila funebris 229 (+229)
NCBITaxon:40372 206 (+206)
NCBITaxon:7257 156 (+156)
NCBITaxon:30019 142 (+142)
Drosophila immigrans 108 (+108)
NCBITaxon:95109 100 (+100)
NCBITaxon:30033 95 (+95)
NCBITaxon:7246 76 (+76)
Drosophila mauritiana 76 (+76)
NCBITaxon:7300 71 (+71)
NCBITaxon:30042 68 (+68)
Drosophila buzzatii 67 (+67)
Drosophila miranda 65 (+65)
Drosophila paulistorum 60 (+60)
NCBITaxon:76712 52 (+52)
Drosophila littoralis 45 (+45)
Drosophila persimilis 39 (+39)
NCBITaxon:7218 35 (+35)
Drosophila mojavensis 34 (+34)
Drosophila ambigua 28 (+28)
Saccharomyces cerevisiae S288C 23 (0)
NCBITaxon:193351 22 (+22)
Drosophila auraria 18 (+18)
NCBITaxon:125945 18 (+18)
NCBITaxon:7282 14 (+14)
NCBITaxon:7283 13 (+13)
NCBITaxon:64960 11 (+11)
NCBITaxon:42026 11 (+11)
NCBITaxon:46794 10 (+10)
NCBITaxon:161732 9 (+9)
NCBITaxon:30036 9 (+9)
Drosophila sechellia 9 (+9)
Drosophila takahashii 8 (+8)
NCBITaxon:169138 7 (+7)
NCBITaxon:47314 7 (+7)
NCBITaxon:30043 7 (+7)
NCBITaxon:94111 6 (+6)
NCBITaxon:7291 5 (+5)
NCBITaxon:69217 4 (+4)
NCBITaxon:46822 4 (+4)
NCBITaxon:40844 4 (+4)
NCBITaxon:30028 4 (+4)
Drosophila eugracilis 4 (+4)
NCBITaxon:30023 4 (+4)
Drosophila equinoxialis 3 (+3)
NCBITaxon:103846 3 (+3)
Drosophila pseudoobscura bogotana 3 (+3)
NCBITaxon:198721 3 (+3)
NCBITaxon:218680 3 (+3)
NCBITaxon:7252 3 (+3)
Drosophila arizonae 2 (+2)
NCBITaxon:141217 2 (+2)
Drosophila erecta 2 (+2)
NCBITaxon:42062 2 (+2)
NCBITaxon:57910 2 (+2)
Scaptodrosophila lebanonensis 2 (+2)
NCBITaxon:133978 2 (+2)
NCBITaxon:7270 2 (+2)
NCBITaxon:7279 2 (+2)
NCBITaxon:133981 2 (+2)
NCBITaxon:7297 2 (+2)
Drosophila madeirensis 2 (+2)
NCBITaxon:195057 2 (+2)
NCBITaxon:134002 2 (+2)
NCBITaxon:7271 2 (+2)
NCBITaxon:30029 2 (+2)
Drosophila yakuba 2 (+2)
NCBITaxon:30056 2 (+2)
NCBITaxon:76946 2 (+2)
Drosophila lutescens 1 (+1)
NCBITaxon:310057 1 (+1)
NCBITaxon:7231 1 (+1)
NCBITaxon:7284 1 (+1)
Other 1 (-182)
NCBITaxon:66368 1 (+1)
Mus musculus domesticus 0 (-68851)

SciGraph Queries

Genotypes

Production Query

Dev Query

field count
genotypes 243531 (-534280)

Reagent Targeted Gene

Production Query

Dev Query

field count
rtg 102866 (-141802)

Variant Loci

Production Query

Dev Query

field count
variants 855272 (-11818)

Sequence Features

Production Query

Dev Query

field count
features 7430634 (-1826875)

Gene Variant Mix-ups

Production Query

Dev Query

field count
variant 5180 (-4)

Genes

Production Query

Dev Query

field count
genes 1832204 (-667654)

Genes in more than one taxa

Production Query

Dev Query

field count
request timeout 0

Gene Disease Mix-ups

Production Query

Dev Query

field count
gene 143 (+143)

nodes with subClassOf cycles (depth 2)

Production Query

Dev Query

field count
node_count 805 (+804)

Number of edges connected to owl:Nothing

Production Query

Dev Query

field count
nothing 0 (0)