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species count
Total 1734472 (0)
Mus musculus 826283 (+462)
Drosophila melanogaster 470407 (0)
Homo sapiens 170521 (0)
Caenorhabditis elegans 116153 (0)
Danio rerio 37638 (0)
Mus musculus domesticus 35045 (-462)
Saccharomyces cerevisiae 26882 (0)
Bos taurus 17024 (0)
Escherichia coli 14337 (0)
organism 3857 (0)
Aequorea victoria 3561 (0)
Sus scrofa 3380 (0)
Gallus gallus 1712 (0)
Drosophila ananassae 611 (0)
Drosophila virilis 577 (0)
Drosophila hydei 538 (0)
Drosophila subobscura 536 (0)
Drosophila simulans 439 (0)
NCBITaxon:86600 349 (0)
Drosophila pseudoobscura pseudoobscura 330 (0)
Rattus norvegicus 256 (0)
Equus caballus 239 (0)
Drosophila willistoni 206 (0)
NCBITaxon:32630 197 (0)
Drosophila funebris 179 (0)
NCBITaxon:40372 149 (0)
Photinus pyralis 143 (0)
Drosophila buzzatii 123 (0)
NCBITaxon:30033 123 (0)
NCBITaxon:7257 122 (0)
Drosophila mauritiana 122 (0)
NCBITaxon:95109 95 (0)
Neurospora crassa 94 (0)
Drosophila immigrans 91 (0)
Drosophila miranda 88 (0)
NCBITaxon:30019 88 (0)
Anopheles gambiae 80 (0)
NCBITaxon:7246 58 (0)
NCBITaxon:32644 57 (0)
NCBITaxon:7300 53 (0)
NCBITaxon:76712 52 (0)
NCBITaxon:7231 50 (0)
Chlamydomonas reinhardtii 47 (0)
Drosophila mojavensis 44 (0)
Human alphaherpesvirus 1 43 (0)
Drosophila affinidisjuncta 42 (0)
Drosophila teissieri 41 (0)
NCBITaxon:30042 39 (0)
Drosophila persimilis 39 (0)
Drosophila littoralis 35 (0)
Xenopus laevis 33 (0)
Drosophila paulistorum 32 (0)
Drosophila takahashii 30 (0)
Drosophila lutescens 27 (0)
Streptococcus pyogenes 27 (0)
NCBITaxon:7218 26 (0)
Drosophila arizonae 26 (0)
NCBITaxon:60717 24 (0)
NCBITaxon:658227 24 (0)
Tribolium castaneum 24 (0)
NCBITaxon:111875 24 (0)
Entacmaea quadricolor 21 (0)
Clostridium tetani 19 (0)
Drosophila ambigua 19 (0)
NCBITaxon:7283 18 (0)
NCBITaxon:42026 18 (0)
Bombyx mori 18 (0)
Escherichia virus P1 17 (0)
NCBITaxon:193351 17 (0)
BNODE:bb2cf0ff025d4622cf5 16 (0)
NCBITaxon:2389 15 (0)
Drosophila auraria 14 (0)
BNODE:a35efa09e0fb254e16a 14 (0)
NCBITaxon:125945 14 (0)
Autographa californica nucleopolyhedrovirus 14 (0)
BNODE:fc3f087ca372cb4d3a9 14 (0)
NCBITaxon:7282 14 (0)
Apis mellifera 13 (0)
NCBITaxon:2387 13 (0)
Musca domestica 13 (0)
Drosophila sechellia 13 (0)
Corynephage beta 13 (0)
NCBITaxon:64960 12 (0)
NCBITaxon:12470 12 (0)
Drosophila hawaiiensis 12 (0)
NCBITaxon:12227 11 (0)
Ovis aries 11 (0)
Oryctolagus cuniculus 11 (0)
NCBITaxon:30036 9 (0)
Enterobacteria phage T7 9 (0)
Drosophila yakuba 9 (0)
NCBITaxon:161732 8 (0)
NCBITaxon:46758 8 (0)
Cupiennius salei 8 (0)
Arabidopsis thaliana 8 (0)
Aedes aegypti 8 (0)
NCBITaxon:7111 8 (0)
NCBITaxon:195057 8 (0)
NCBITaxon:47314 8 (0)
NCBITaxon:12287 8 (0)
Canis lupus familiaris 8 (0)
Kluyveromyces lactis 7 (0)
Natronomonas pharaonis 7 (0)
Bradyrhizobium sp. 7 (0)
Ricinus communis 7 (0)
NCBITaxon:7291 6 (0)
Danaus plexippus 6 (0)
Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium 6 (0)
Artemia franciscana 6 (0)
NCBITaxon:46794 6 (0)
NCBITaxon:94111 6 (0)
NCBITaxon:6136 6 (0)
Human immunodeficiency virus 1 6 (0)
NCBITaxon:30043 6 (0)
NCBITaxon:38358 6 (0)
Drosophila grimshawi 6 (0)
NCBITaxon:148603 6 (0)
Scaptodrosophila lebanonensis 6 (0)
Macaca mulatta polyomavirus 1 5 (0)
NCBITaxon:955 5 (0)
Ceratitis capitata 5 (0)
NCBITaxon:8204 5 (0)
NCBITaxon:76946 5 (0)
Mesocricetus auratus 5 (0)
NCBITaxon:103846 5 (0)
Human mastadenovirus C 5 (0)
Human adenovirus 5 5 (0)
Listeria monocytogenes 5 (0)
BNODE:13446b3196cf19c664c 5 (0)
Bordetella pertussis 5 (0)
NCBITaxon:95512 4 (0)
NCBITaxon:30023 4 (0)
Rhodococcus sp. 4 (0)
NCBITaxon:496660 4 (0)
NCBITaxon:12022 4 (0)
Zygosaccharomyces rouxii 4 (0)
NCBITaxon:45455 4 (0)
Drosophila eugracilis 4 (0)
Drosophila C virus 4 (0)
Anopheles funestus 4 (0)
Guillardia theta 4 (0)
Tomato bushy stunt virus 4 (0)
NCBITaxon:169138 4 (0)
NCBITaxon:7010 4 (0)
NCBITaxon:28456 4 (0)
Ciona intestinalis 4 (0)
NCBITaxon:7740 4 (0)
Culex pipiens 3 (0)
Euglena gracilis 3 (0)
Bacillus subtilis 3 (0)
Zygosaccharomyces bailii 3 (0)
Staphylococcus aureus 3 (0)
Glossina morsitans 3 (0)
Toxoplasma gondii 3 (0)
Vibrio parahaemolyticus 3 (0)
NCBITaxon:4957 3 (0)
Lucilia cuprina 3 (0)
NCBITaxon:55100 3 (0)
Pseudopleuronectes americanus 3 (0)
BNODE:e66d689dd86a07aea60 3 (0)
NCBITaxon:11309 3 (0)
NCBITaxon:418985 3 (0)
Spodoptera frugiperda ascovirus 1a 3 (0)
NCBITaxon:2138 3 (0)
NCBITaxon:69217 3 (0)
NCBITaxon:80765 3 (0)
Vibrio cholerae 3 (0)
BNODE:eaba42a506034628afd 3 (0)
Heliothis virescens 3 (0)
NCBITaxon:7249 3 (0)
Bacillus anthracis 3 (0)
Monosiga brevicollis 3 (0)
BNODE:f8141fdf82ae439afe6 3 (0)
NCBITaxon:196280 3 (0)
NCBITaxon:218680 3 (0)
Hydra vulgaris 3 (0)
NCBITaxon:30028 2 (0)
Limulus polyphemus 2 (0)
NCBITaxon:7297 2 (0)
NCBITaxon:7119 2 (0)
Bungarus multicinctus 2 (0)
NCBITaxon:82678 2 (0)
Blattella germanica 2 (0)
Schistosoma japonicum 2 (0)
NCBITaxon:5530 2 (0)
Glycine max 2 (0)
NCBITaxon:45264 2 (0)
Hadronyche versuta 2 (0)
Sindbis virus 2 (0)
NCBITaxon:42062 2 (0)
NCBITaxon:1208342 2 (0)
NCBITaxon:30056 2 (0)
Clavularia sp. 2 (0)
Campoletis sonorensis ichnovirus 2 (0)
Heteractis crispa 2 (0)
NCBITaxon:108931 2 (0)
NCBITaxon:62873 2 (0)
NCBITaxon:57910 2 (0)
Schistocerca americana 2 (0)
Human betaherpesvirus 5 2 (0)
Deinococcus radiodurans 2 (0)
NCBITaxon:88209 2 (0)
NCBITaxon:109461 2 (0)
Escherichia virus Lambda 2 (0)
Oryza sativa 2 (0)
NCBITaxon:7038 2 (0)
Pan troglodytes 2 (0)
Drosophila madeirensis 2 (0)
Providencia stuartii 2 (0)
NCBITaxon:191210 2 (0)
NCBITaxon:35525 2 (0)
Triticum aestivum 2 (0)
Xenopus (Silurana) tropicalis 2 (0)
Drosophila pseudoobscura bogotana 2 (0)
Drosophila erecta 2 (0)
NCBITaxon:40844 2 (0)
Drosophila equinoxialis 2 (0)
Cricket paralysis virus 2 (0)
Aeromonas salmonicida 2 (0)
Human papillomavirus type 18 2 (0)
NCBITaxon:46822 2 (0)
NCBITaxon:7279 2 (0)
Amphimedon queenslandica 2 (0)
Trichoplax adhaerens 2 (0)
Bacillus halodurans 2 (0)
Acyrthosiphon pisum 2 (0)
Rhodopseudomonas palustris 2 (0)
Helicobacter pylori 2 (0)
NCBITaxon:7284 1 (0)
NCBITaxon:1962953 1 (0)
NCBITaxon:56459 1 (0)
Halocynthia roretzi 1 (0)
Conus marmoreus 1 (0)
Nodamura virus 1 (0)
Vaccinia virus 1 (0)
NCBITaxon:12232 1 (0)
BNODE:1f58a0779e93c2ed4d2 1 (0)
Saccharomyces cerevisiae S288C 1 (0)
Enterococcus faecalis 1 (0)
NCBITaxon:161601 1 (0)
Cricetulus griseus 1 (0)
NCBITaxon:118641 1 (0)
Human T-lymphotropic virus 2 1 (0)
Ixodes scapularis 1 (0)
Potato virus X 1 (0)
Brevundimonas diminuta 1 (0)
NCBITaxon:39722 1 (0)
NCBITaxon:1051066 1 (0)
NCBITaxon:703 1 (0)
NCBITaxon:139456 1 (0)
NCBITaxon:499226 1 (0)
NCBITaxon:7271 1 (0)
NCBITaxon:133978 1 (0)
NCBITaxon:4808 1 (0)
Turnip crinkle virus 1 (0)
Armoracia rusticana 1 (0)
Megaselia scalaris 1 (0)
Manduca sexta 1 (0)
NCBITaxon:133981 1 (0)
NCBITaxon:7270 1 (0)
NCBITaxon:35572 1 (0)
Human T-cell leukemia virus type I 1 (0)
NCBITaxon:7248 1 (0)
NCBITaxon:55084 1 (0)
NCBITaxon:301887 1 (0)
NCBITaxon:491304 1 (0)
Beet yellows virus 1 (0)
BNODE:b1a448feb24de46088b 1 (0)
NCBITaxon:198721 1 (0)
NCBITaxon:66368 1 (0)
Hemitripterus americanus 1 (0)
NCBITaxon:35743 1 (0)
Pediculus humanus 1 (0)
Drosophila borealis 1 (0)
NCBITaxon:2014434 1 (0)
NCBITaxon:7007 1 (0)
NCBITaxon:32392 1 (0)
NCBITaxon:310057 1 (0)
Penaeus merguiensis 1 (0)
NCBITaxon:7252 1 (0)
NCBITaxon:11913 1 (0)
NCBITaxon:134002 1 (0)
NCBITaxon:46745 1 (0)
NCBITaxon:10456 1 (0)
Rhodobacter sphaeroides 1 (0)
NCBITaxon:30029 1 (0)
Pseudomonas aeruginosa 1 (0)
Cucurbit aphid-borne yellows virus 1 (0)
NCBITaxon:51655 1 (0)
Streptomyces hygroscopicus 1 (0)
Drosophila orena 1 (0)
NCBITaxon:3821 1 (0)
NCBITaxon:141217 1 (0)
NCBITaxon:191766 1 (0)
Arachis hypogaea 1 (0)
NCBITaxon:1649241 1 (0)
NCBITaxon:7120 1 (0)
BNODE:e3f956b320a9fec1cf3 1 (0)
NCBITaxon:1162220 1 (0)
Peanut clump virus 1 (0)
Other 0 (0)

Variant Phenotype Associations

Production Query

Dev Query

species count
Total 3511241 (0)
Homo sapiens 1885916 (0)
organism 631493 (0)
Mus musculus 356018 (+746)
Drosophila melanogaster 210791 (0)
Bos taurus 125198 (0)
Danio rerio 92055 (0)
Caenorhabditis elegans 91061 (0)
Mus musculus domesticus 68105 (-746)
Sus scrofa 34559 (0)
Gallus gallus 13339 (0)
Ovis aries 1493 (0)
Equus caballus 1007 (0)
Other 183 (0)
Saccharomyces cerevisiae S288C 23 (0)

Disease Phenotype Associations

Production Query

Dev Query

species count
Total 146020 (0)
Other 146004 (0)
Homo sapiens 16 (0)

Relations

Production Query

Dev Query

relation count
Total 42679273 (+238899)
is_about 7432654 (-728974)
mentions 5419667 (+728974)
has phenotype 5219880 (+76030)
Other 4815484 (-76030)
interacts with 3623883 (-1)
in paralogy relationship with 2786930 (0)
Source 2594262 (0)
in 1 to 1 orthology relationship with 1989602 (-8)
expressed in 1858471 (0)
in orthology relationship with 1711436 (+8)
involved_in 1338075 (+234320)
is_allele_of 1021692 (0)
has_genotype 747811 (0)
is part of 356815 (0)
enables 318670 (0)
in xenology relationship with 293233 (0)
targets_gene 175493 (0)
is_expression_variant_of 171268 (0)
has_affected_feature 157752 (0)
sequence_derives_from 150128 (0)
is marker for 140043 (+4)
colocalizes with 87835 (+4579)
is_reference_allele_of 58137 (0)
pathogenic_for_condition 55297 (0)
is model of 37737 (0)
contributes to condition 31070 (0)
derives_from 29807 (0)
genetically interacts with 26231 (+1)
likely_pathogenic_for_condition 18671 (-3)
causes condition 10833 (-1)
contributes to 351 (0)
disease has basis in feature 53 (0)
is_variant_allele_of 2 (0)

Gene Disease Associations

Production Query

Dev Query

species count
Total 27627 (0)
Homo sapiens 26575 (0)
Canis lupus familiaris 231 (0)
Mus musculus 219 (+3)
Bos taurus 124 (0)
Felis catus 62 (0)
Ovis aries 47 (0)
Gallus gallus 43 (0)
Sus scrofa 43 (0)
Equus caballus 39 (0)
Drosophila melanogaster 34 (0)
Rattus norvegicus 33 (0)
Danio rerio 24 (0)
Capra hircus 15 (0)
Oryctolagus cuniculus 12 (0)
Coturnix japonica 9 (0)
Neovison vison 5 (0)
Equus asinus 5 (0)
Bubalus bubalis 4 (0)
Caenorhabditis elegans 4 (0)
Mesocricetus auratus 4 (0)
Macaca mulatta 3 (0)
Oryzias latipes 3 (0)
Vulpes lagopus 3 (0)
Bos grunniens 3 (0)
Mus musculus domesticus 3 (-3)
NCBITaxon:198806 3 (0)
Vulpes vulpes 2 (0)
NCBITaxon:48883 2 (0)
Mustela putorius furo 2 (0)
Meleagris gallopavo 2 (0)
Macaca fascicularis 2 (0)
Mammuthus primigenius 2 (0)
NCBITaxon:32536 2 (0)
NCBITaxon:61386 1 (0)
NCBITaxon:34892 1 (0)
Numida meleagris 1 (0)
Pan troglodytes 1 (0)
NCBITaxon:43597 1 (0)
NCBITaxon:9690 1 (0)
NCBITaxon:273489 1 (0)
NCBITaxon:38666 1 (0)
NCBITaxon:345164 1 (0)
Ursus americanus 1 (0)
Tursiops truncatus 1 (0)
NCBITaxon:57662 1 (0)
NCBITaxon:61402 1 (0)
NCBITaxon:61455 1 (0)
NCBITaxon:54059 1 (0)
Ctenopharyngodon idella 1 (0)
Rangifer tarandus 1 (0)
Xenopus (Silurana) tropicalis 1 (0)
Cavia porcellus 1 (0)
Camelus dromedarius 1 (0)
NCBITaxon:328808 1 (0)
Takifugu rubripes 1 (0)
NCBITaxon:9773 1 (0)
Bos mutus 1 (0)
Sus scrofa domesticus 1 (0)
NCBITaxon:70340 1 (0)
Hylobates lar 1 (0)
NCBITaxon:37029 1 (0)
NCBITaxon:61406 1 (0)
Coturnix coturnix 1 (0)
NCBITaxon:255217 1 (0)
Elephas maximus 1 (0)
Dromaius novaehollandiae 1 (0)
NCBITaxon:8523 1 (0)
Phoenicopterus ruber 1 (0)
NCBITaxon:57661 1 (0)
Peromyscus maniculatus 1 (0)
NCBITaxon:68352 1 (0)
Anas platyrhynchos 1 (0)
Canis latrans 1 (0)
NCBITaxon:46844 1 (0)
Sciurus carolinensis 1 (0)
NCBITaxon:120794 1 (0)
Peromyscus polionotus 1 (0)
Balaenoptera acutorostrata 1 (0)
NCBITaxon:118797 1 (0)
NCBITaxon:9579 1 (0)
Delphinapterus leucas 1 (0)
NCBITaxon:9691 1 (0)
Symphalangus syndactylus 1 (0)
Panthera tigris 1 (0)
Astyanax 1 (0)
Gorilla gorilla 1 (0)
Oreochromis niloticus 1 (0)
Canis lupus 1 (0)
Aepyceros melampus 1 (0)
Cebus apella 1 (0)
NCBITaxon:338458 1 (0)
NCBITaxon:103584 1 (0)
Macaca fuscata 1 (0)
Panthera tigris tigris 1 (0)
Columba livia 1 (0)
NCBITaxon:87177 1 (0)
Other 0 (0)

Genotype Phenotype Associations

Production Query

Dev Query

species count
Total 961112 (0)
Drosophila melanogaster 412276 (0)
Mus musculus 353003 (+157)
Danio rerio 101929 (0)
Homo sapiens 74404 (0)
organism 17051 (0)
Mus musculus domesticus 2383 (-157)
Mus musculus musculus 14 (0)
Mus musculus molossinus 13 (0)
Mus musculus castaneus 12 (0)
NCBITaxon:477815 12 (0)
NCBITaxon:10102 8 (0)
Mus 4 (0)
Mus spretus 2 (0)
Mus musculus bactrianus 1 (0)
Other 0 (0)

Gene Phenotype Associations

Production Query

Dev Query

species count
Total 722713 (0)
Mus musculus 202043 (+205)
Drosophila melanogaster 196075 (0)
Homo sapiens 130974 (0)
Saccharomyces cerevisiae S288C 68230 (0)
Danio rerio 56669 (0)
Caenorhabditis elegans 53863 (0)
Mus musculus domesticus 7335 (-205)
organism 6059 (0)
Canis lupus familiaris 476 (0)
Rattus norvegicus 461 (0)
Bos taurus 163 (0)
Felis catus 132 (0)
Ovis aries 57 (0)
Sus scrofa 31 (0)
Equus caballus 31 (0)
Gallus gallus 19 (0)
Capra hircus 18 (0)
Phoenicopterus ruber 17 (0)
Mustela putorius furo 10 (0)
Oryctolagus cuniculus 10 (0)
Macaca mulatta 4 (0)
Neovison vison 4 (0)
Oryzias latipes 4 (0)
Mesocricetus auratus 3 (0)
Meleagris gallopavo 3 (0)
Vulpes vulpes 2 (0)
Bubalus bubalis 2 (0)
Numida meleagris 1 (0)
NCBITaxon:43597 1 (0)
NCBITaxon:9690 1 (0)
NCBITaxon:38666 1 (0)
Vulpes lagopus 1 (0)
NCBITaxon:68352 1 (0)
Ursus americanus 1 (0)
Bos grunniens 1 (0)
Sciurus carolinensis 1 (0)
Peromyscus polionotus 1 (0)
Mammuthus primigenius 1 (0)
NCBITaxon:61402 1 (0)
NCBITaxon:70340 1 (0)
NCBITaxon:27706 1 (0)
Coturnix japonica 1 (0)
Panthera tigris tigris 1 (0)
NCBITaxon:32536 1 (0)
NCBITaxon:87177 1 (0)
Other 0 (0)

Model Disease Associations

Production Query

Dev Query

species count
Total 26468 (0)
Homo sapiens 11980 (0)
Mus musculus 7203 (+5)
Caenorhabditis elegans 3037 (0)
Drosophila melanogaster 1801 (0)
Danio rerio 908 (0)
Carnivora 684 (0)
Mus musculus domesticus 499 (-5)
Ruminantia 144 (0)
organism 97 (0)
Felidae 55 (0)
Equidae 34 (0)
Suidae 5 (0)
Sus 5 (0)
Bos taurus 3 (0)
Gallus gallus 3 (0)
NCBITaxon:477815 2 (0)
Other 2 (0)
Bovidae 2 (0)
Mus musculus musculus 2 (0)
Mus musculus castaneus 1 (0)
Viridiplantae 1 (0)

Variant Genotype Associations

Production Query

Dev Query

species count
Total 1685569 (0)
Drosophila melanogaster 873495 (0)
Mus musculus 645942 (-9)
Danio rerio 153362 (0)
organism 7128 (0)
Homo sapiens 4525 (0)
Mus musculus domesticus 1040 (+9)
NCBITaxon:10102 20 (0)
Mus musculus molossinus 15 (0)
Mus musculus musculus 11 (0)
Mus musculus bactrianus 7 (0)
Mus spretus 6 (0)
Mus 4 (0)
Mus musculus castaneus 4 (0)
Rattus norvegicus 4 (0)
Macaca mulatta 2 (0)
Cricetulus griseus 1 (0)
Bos taurus 1 (0)
Plecturocebus moloch 1 (0)
Saguinus labiatus 1 (0)
Other 0 (0)

Variant Disease Associations

Production Query

Dev Query

species count
Total 104633 (0)
Homo sapiens 103822 (0)
organism 773 (0)
Mus musculus 22 (+1)
Mus musculus domesticus 15 (-1)
Bos taurus 1 (0)
Other 0 (0)

SciGraph Queries

Genes

Production Query

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field count
genes 1832204 (-667654)

Genotypes

Production Query

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field count
genotypes 243531 (-534280)

Genes in more than one taxa

Production Query

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field count
request timeout 0

Gene Variant Mix-ups

Production Query

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field count
variant 5180 (-4)

Reagent Targeted Gene

Production Query

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field count
rtg 102866 (-141802)

Gene Disease Mix-ups

Production Query

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field count
gene 143 (+143)

Variant Loci

Production Query

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field count
variants 855272 (-11818)

Sequence Features

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field count
features 7430634 (-1826875)

nodes with subClassOf cycles (depth 2)

Production Query

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field count
node_count 805 (+804)

Number of edges connected to owl:Nothing

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field count
nothing 0 (0)