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relation count
Total 32695255 (-4807741)
is_about 7093450 (+183797)
mentions 5654150 (+154488)
has phenotype 3821432 (-1728703)
interacts with 3625337 (-7735)
in paralogy relationship with 2046749 (-40194)
Source 1976803 (-280338)
in orthology relationship with 1565991 (-17458)
expressed in 1453347 (+306)
in 1 to 1 orthology relationship with 1346787 (-2660)
involved in 1108274 (+180069)
is_allele_of 858953 (+3860)
is part of 330367 (+135091)
enables 291164 (+111882)
Other 269909 (-2977429)
is marker for 223932 (+13173)
is_expression_variant_of 186840 (-8335)
has_affected_feature 176431 (-65735)
targets_gene 173123 (+1089)
in xenology relationship with 146836 (+144)
sequence_derives_from 111207 (+18077)
colocalizes with 75225 (+112)
pathogenic_for_condition 52392 (+2926)
is model of 36414 (-50)
derives_from 29655 (+90)
genetically interacts with 20374 (+5)
likely_pathogenic_for_condition 12682 (+1134)
contributes to 6173 (-30200)
has_genotype 1215 (-455175)
disease has basis in feature 38 (+28)
is_reference_allele_of 4 (0)
is_variant_allele_of 1 (0)

Gene Variant Associations

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Dev Query

species count
Total 1506559 (-51044)
Mus musculus 812749 (+3327)
Drosophila melanogaster 296628 (+2027)
Homo sapiens 188696 (-62802)
Caenorhabditis elegans 114582 (+1550)
Danio rerio 32551 (-869)
Saccharomyces cerevisiae 22299 (+4249)
Bos taurus 15793 (+387)
Escherichia coli 9535 (+82)
organism 4446 (+4446)
Sus scrofa 3265 (+116)
Aequorea victoria 2089 (+58)
Gallus gallus 1629 (+11)
NCBITaxon:86600 315 (+7)
Rattus norvegicus 236 (+3)
Equus caballus 183 (0)
NCBITaxon:32630 172 (+16)
Photinus pyralis 116 (0)
Anopheles gambiae 73 (0)
NCBITaxon:32644 57 (+3)
Neurospora crassa 55 (+2)
NCBITaxon:7231 49 (0)
Drosophila mauritiana 49 (0)
Chlamydomonas reinhardtii 44 (+6)
Drosophila affinidisjuncta 42 (0)
Drosophila virilis 41 (+3)
Xenopus laevis 31 (0)
Human alphaherpesvirus 1 25 (-1)
Tribolium castaneum 24 (0)
Drosophila pseudoobscura pseudoobscura 24 (+1)
Drosophila simulans 22 (0)
NCBITaxon:2389 20 (0)
Clostridium tetani 18 (+1)
Bombyx mori 18 (0)
Entacmaea quadricolor 18 (0)
Streptococcus pyogenes 17 (+1)
:.well-known/genid/bb2cf0ff025d4622cf5 16 (0)
Escherichia virus P1 16 (0)
Musca domestica 13 (0)
Corynephage beta 13 (0)
Apis mellifera 13 (0)
Autographa californica nucleopolyhedrovirus 13 (0)
NCBITaxon:12470 12 (0)
Drosophila mojavensis 12 (0)
Drosophila hawaiiensis 12 (0)
Drosophila ananassae 12 (0)
NCBITaxon:12227 11 (0)
Drosophila miranda 11 (0)
NCBITaxon:2387 11 (0)
Oryctolagus cuniculus 10 (0)
Escherichia virus MS2 9 (0)
NCBITaxon:12287 8 (0)
Arabidopsis thaliana 8 (+1)
Aedes aegypti 8 (0)
NCBITaxon:30033 8 (0)
NCBITaxon:7111 8 (+1)
Cupiennius salei 8 (0)
NCBITaxon:496660 7 (-1)
Bradyrhizobium sp. 7 (0)
Kluyveromyces lactis 7 (0)
Enterobacteria phage T7 7 (0)
:.well-known/genid/a35efa09e0fb254e16a 6 (0)
Drosophila hydei 6 (0)
Artemia franciscana 6 (0)
NCBITaxon:148603 6 (0)
Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium 6 (0)
NCBITaxon:38358 6 (0)
Ricinus communis 6 (0)
NCBITaxon:6136 6 (0)
Human immunodeficiency virus 1 6 (0)
Danaus plexippus 6 (0)
Drosophila willistoni 5 (0)
Macaca mulatta polyomavirus 1 5 (0)
NCBITaxon:8204 5 (0)
Ovis aries 5 (0)
Human mastadenovirus C 5 (0)
Drosophila immigrans 5 (0)
Natronomonas pharaonis 5 (0)
Ceratitis capitata 5 (0)
Drosophila grimshawi 5 (0)
Listeria monocytogenes 5 (0)
Drosophila yakuba 5 (0)
Canis lupus familiaris 5 (0)
Human adenovirus 5 5 (0)
Bordetella pertussis 5 (0)
Scaptodrosophila lebanonensis 5 (0)
Tomato bushy stunt virus 4 (0)
NCBITaxon:28456 4 (+1)
NCBITaxon:45455 4 (0)
NCBITaxon:955 4 (0)
Ciona intestinalis 4 (0)
NCBITaxon:7010 4 (0)
Rhodococcus sp. 4 (0)
Zygosaccharomyces rouxii 4 (0)
NCBITaxon:64279 4 (0)
Anopheles funestus 4 (0)
NCBITaxon:95512 4 (0)
Drosophila teissieri 3 (0)
NCBITaxon:418985 3 (0)
Heliothis virescens 3 (0)
Toxoplasma gondii 3 (0)
Hydra vulgaris 3 (0)
NCBITaxon:55100 3 (0)
NCBITaxon:11309 3 (0)
Pseudopleuronectes americanus 3 (0)
Zygosaccharomyces bailii 3 (0)
:.well-known/genid/e66d689dd86a07aea60 3 (0)
Culex pipiens 3 (0)
Staphylococcus aureus 3 (0)
Vibrio cholerae 3 (0)
Bacillus anthracis 3 (0)
NCBITaxon:196280 3 (0)
:.well-known/genid/f8141fdf82ae439afe6 3 (0)
NCBITaxon:80765 3 (0)
NCBITaxon:46758 3 (0)
Lucilia cuprina 3 (0)
Vibrio parahaemolyticus 3 (0)
Bacillus subtilis 3 (0)
Euglena gracilis 3 (0)
Deinococcus radiodurans 3 (+1)
Monosiga brevicollis 3 (0)
Glossina morsitans 3 (0)
NCBITaxon:4957 3 (0)
NCBITaxon:5530 2 (0)
Amphimedon queenslandica 2 (0)
NCBITaxon:82678 2 (0)
Oryza sativa 2 (+2)
Cricket paralysis virus 2 (0)
Hadronyche versuta 2 (0)
Bungarus multicinctus 2 (+1)
Schistocerca americana 2 (0)
Drosophila sechellia 2 (0)
Blattella germanica 2 (0)
Rhodopseudomonas palustris 2 (0)
NCBITaxon:62873 2 (0)
NCBITaxon:109461 2 (0)
Providencia stuartii 2 (+1)
NCBITaxon:7740 2 (0)
NCBITaxon:35525 2 (0)
Drosophila persimilis 2 (0)
Campoletis sonorensis ichnovirus 2 (0)
Limulus polyphemus 2 (0)
Acyrthosiphon pisum 2 (0)
Schistosoma japonicum 2 (0)
NCBITaxon:1208342 2 (0)
Sindbis virus 2 (0)
Trichoplax adhaerens 2 (0)
Human papillomavirus type 18 2 (+2)
NCBITaxon:7119 2 (0)
NCBITaxon:88209 2 (0)
NCBITaxon:103846 2 (0)
Drosophila subobscura 2 (0)
Triticum aestivum 2 (0)
Bacillus halodurans 2 (0)
Clavularia sp. 2 (0)
Helicobacter pylori 2 (0)
NCBITaxon:45264 2 (0)
Aeromonas salmonicida 2 (0)
Human betaherpesvirus 5 2 (0)
NCBITaxon:7038 2 (0)
Mesocricetus auratus 2 (0)
Hemitripterus americanus 1 (0)
Drosophila orena 1 (0)
NCBITaxon:1649241 1 (0)
Spodoptera frugiperda ascovirus 1a 1 (0)
NCBITaxon:2014434 1 (+1)
Vaccinia virus 1 (0)
Saccharomyces cerevisiae S288C 1 (0)
NCBITaxon:191210 1 (0)
Human T-lymphotropic virus 1 1 (0)
Potato virus X 1 (0)
Brevundimonas diminuta 1 (0)
NCBITaxon:7300 1 (0)
NCBITaxon:7007 1 (0)
Halocynthia roretzi 1 (0)
NCBITaxon:11913 1 (0)
Cucurbit aphid-borne yellows virus 1 (0)
NCBITaxon:210840 1 (0)
NCBITaxon:12232 1 (0)
NCBITaxon:39722 1 (0)
Megaselia scalaris 1 (0)
Peanut clump virus 1 (0)
NCBITaxon:55084 1 (0)
Pediculus humanus 1 (0)
:.well-known/genid/3ac34b5428d3d051863 1 (0)
Fenneropenaeus merguiensis 1 (0)
NCBITaxon:703 1 (0)
NCBITaxon:301887 1 (0)
NCBITaxon:35572 1 (0)
NCBITaxon:1051066 1 (0)
Beet yellows virus 1 (0)
NCBITaxon:32392 1 (0)
Arachis hypogaea 1 (0)
NCBITaxon:46745 1 (0)
NCBITaxon:191766 1 (0)
NCBITaxon:47314 1 (0)
NCBITaxon:95109 1 (0)
NCBITaxon:7120 1 (0)
Xenopus (Silurana) tropicalis 1 (+1)
Pseudomonas aeruginosa 1 (0)
Nodamura virus 1 (0)
Pan troglodytes 1 (0)
:.well-known/genid/1f58a0779e93c2ed4d2 1 (0)
NCBITaxon:118641 1 (+1)
NCBITaxon:10456 1 (0)
Manduca sexta 1 (0)
NCBITaxon:56459 1 (0)
Streptomyces hygroscopicus 1 (0)
NCBITaxon:161601 1 (0)
Conus marmoreus 1 (0)
Human T-lymphotropic virus 2 1 (0)
Turnip crinkle virus 1 (0)
Armoracia rusticana 1 (0)
Ixodes scapularis 1 (0)
Enterococcus faecalis 1 (0)
Cricetulus griseus 1 (0)
NCBITaxon:303354 0 (-1)
Other 0 (-3679)

Gene Disease Associations

Production Query

Dev Query

species count
Total 25183 (-9493)
Homo sapiens 24169 (-9528)
Canis lupus familiaris 234 (0)
Mus musculus 190 (+25)
Bos taurus 120 (+1)
Felis catus 61 (0)
Ovis aries 47 (0)
Sus scrofa 43 (+1)
Gallus gallus 41 (0)
Equus caballus 40 (-1)
Drosophila melanogaster 32 (0)
Rattus norvegicus 29 (+3)
Danio rerio 21 (+5)
Capra hircus 15 (0)
Oryctolagus cuniculus 12 (0)
Coturnix japonica 9 (0)
Equus asinus 5 (0)
Neovison vison 5 (0)
organism 5 (+5)
Bubalus bubalis 4 (0)
Caenorhabditis elegans 4 (0)
Oryzias latipes 4 (0)
Mesocricetus auratus 4 (0)
Vulpes lagopus 3 (0)
Macaca mulatta 3 (0)
NCBITaxon:198806 3 (0)
Bos grunniens 3 (0)
Vulpes vulpes 2 (0)
NCBITaxon:48883 2 (0)
NCBITaxon:32536 2 (0)
Mustela putorius furo 2 (0)
Macaca fascicularis 2 (0)
Meleagris gallopavo 2 (0)
Mammuthus primigenius 2 (0)
Symphalangus syndactylus 1 (0)
Aepyceros melampus 1 (0)
NCBITaxon:87177 1 (0)
Delphinapterus leucas 1 (0)
NCBITaxon:8523 1 (0)
Camelus dromedarius 1 (0)
Balaenoptera acutorostrata 1 (0)
NCBITaxon:46844 1 (0)
Canis lupus 1 (0)
Takifugu rubripes 1 (0)
NCBITaxon:61406 1 (0)
Panthera tigris tigris 1 (0)
NCBITaxon:103584 1 (0)
NCBITaxon:9690 1 (0)
Panthera tigris 1 (0)
NCBITaxon:255217 1 (0)
Macaca fuscata 1 (0)
NCBITaxon:37029 1 (0)
Ctenopharyngodon idella 1 (0)
Astyanax 1 (0)
Sus scrofa domesticus 1 (0)
Numida meleagris 1 (0)
Sciurus carolinensis 1 (0)
Cavia porcellus 1 (0)
Anas platyrhynchos 1 (0)
Elephas maximus 1 (0)
NCBITaxon:61402 1 (0)
NCBITaxon:43597 1 (0)
NCBITaxon:328808 1 (0)
NCBITaxon:61455 1 (0)
NCBITaxon:57662 1 (0)
NCBITaxon:345164 1 (0)
NCBITaxon:38666 1 (0)
NCBITaxon:70340 1 (0)
Rangifer tarandus 1 (0)
Xenopus (Silurana) tropicalis 1 (+1)
Columba livia 1 (0)
NCBITaxon:9773 1 (0)
Ursus americanus 1 (0)
Peromyscus polionotus 1 (0)
Hylobates lar 1 (0)
Pan troglodytes 1 (0)
Canis latrans 1 (0)
Oreochromis niloticus 1 (0)
NCBITaxon:68352 1 (0)
Peromyscus maniculatus 1 (0)
NCBITaxon:54059 1 (0)
Phoenicopterus ruber 1 (0)
Tursiops truncatus 1 (0)
NCBITaxon:120794 1 (0)
Coturnix coturnix 1 (0)
NCBITaxon:34892 1 (0)
NCBITaxon:57661 1 (0)
NCBITaxon:273489 1 (0)
NCBITaxon:9579 1 (0)
Dromaius novaehollandiae 1 (0)
NCBITaxon:9691 1 (0)
NCBITaxon:61386 1 (0)
Gorilla gorilla 1 (0)
Cebus apella 1 (0)
NCBITaxon:338458 1 (0)
NCBITaxon:118797 1 (0)
Bos mutus 1 (0)
Other 0 (-5)

Model Disease Associations

Production Query

Dev Query

species count
Total 25274 (-88)
Homo sapiens 11823 (+41)
Mus musculus 7480 (+73)
Caenorhabditis elegans 2854 (+1521)
Drosophila melanogaster 1619 (+972)
Danio rerio 749 (+49)
Carnivora 544 (+544)
Ruminantia 116 (+116)
Felidae 42 (+42)
Equidae 27 (+27)
Sus 5 (+5)
Gallus gallus 3 (+3)
Bos taurus 3 (0)
Suidae 3 (+3)
Other 2 (0)
NCBITaxon:477815 2 (+2)
Viridiplantae 1 (0)
Mus musculus castaneus 1 (0)
Mammalia 0 (-970)
Caenorhabditis 0 (-1602)
Aves 0 (-3)
Diptera 0 (-911)

Variant Phenotype Associations

Production Query

Dev Query

species count
Total 3179739 (-717397)
Homo sapiens 1892719 (-760755)
Other 462055 (-94156)
Mus musculus 370288 (+20163)
organism 128679 (+128679)
Bos taurus 94068 (+4605)
Caenorhabditis elegans 90218 (+869)
Danio rerio 72782 (-15090)
Drosophila melanogaster 47021 (-3339)
Sus scrofa 13857 (+1154)
Gallus gallus 6064 (+310)
Ovis aries 1324 (+167)
Equus caballus 474 (+22)
Oncorhynchus mykiss 122 (0)
Saccharomyces cerevisiae 43 (-24)
Saccharomyces cerevisiae S288C 23 (0)
NCBITaxon:2387 1 (-2)
Escherichia coli 1 (0)

Gene Phenotype Associations

Production Query

Dev Query

species count
Total 540870 (-252655)
Mus musculus 208785 (-6025)
Homo sapiens 148764 (-23410)
Saccharomyces cerevisiae S288C 68230 (+6)
Caenorhabditis elegans 53254 (+714)
Danio rerio 42746 (-11592)
organism 9644 (+9644)
Bos taurus 6258 (+51)
Rattus norvegicus 1236 (0)
Sus scrofa 838 (+54)
Canis lupus familiaris 478 (0)
Gallus gallus 298 (+4)
Felis catus 125 (0)
Equus caballus 63 (0)
Ovis aries 57 (0)
Capra hircus 18 (0)
Phoenicopterus ruber 17 (0)
Mustela putorius furo 10 (0)
Oryctolagus cuniculus 10 (0)
Oryzias latipes 4 (0)
Neovison vison 4 (0)
Macaca mulatta 4 (0)
Meleagris gallopavo 3 (0)
Mesocricetus auratus 3 (0)
Vulpes vulpes 2 (0)
Bubalus bubalis 2 (0)
Ursus americanus 1 (0)
NCBITaxon:43597 1 (0)
NCBITaxon:87177 1 (0)
Peromyscus polionotus 1 (0)
NCBITaxon:68352 1 (0)
NCBITaxon:32536 1 (0)
Panthera tigris tigris 1 (0)
NCBITaxon:9690 1 (0)
Mammuthus primigenius 1 (0)
NCBITaxon:38666 1 (0)
Numida meleagris 1 (0)
Bos grunniens 1 (0)
Sciurus carolinensis 1 (0)
NCBITaxon:61402 1 (0)
Vulpes lagopus 1 (0)
Coturnix japonica 1 (0)
NCBITaxon:70340 1 (0)
Escherichia coli 0 (-1)
Other 0 (-6505)
Drosophila melanogaster 0 (-215545)
Saccharomyces cerevisiae 0 (-49)
NCBITaxon:2387 0 (-1)

Genotype Phenotype Associations

Production Query

Dev Query

species count
Danio rerio 85658 (-11793)
Total 85658 (-863032)
NCBITaxon:477815 0 (-11)
Mus 0 (-12)
Homo sapiens 0 (-116399)
Mus musculus musculus 0 (-13)
Mus musculus castaneus 0 (-12)
Other 0 (-10069)
Mus musculus molossinus 0 (-11)
Mus spretus 0 (-1)
Mus musculus bactrianus 0 (-1)
Mus musculus 0 (-327285)
Mus musculus domesticus 0 (-36)
Drosophila melanogaster 0 (-397389)

Disease Phenotype Associations

Production Query

Dev Query

species count
Total 219348 (+1036)
Other 219343 (+1036)
Homo sapiens 5 (0)

Variant Disease Associations

Production Query

Dev Query

species count
Total 64736 (-16335)
Homo sapiens 64561 (-15771)
organism 175 (+175)
Other 0 (-739)

Variant Genotype Associations

Production Query

Dev Query

species count
Total 85200 (-967703)
Danio rerio 85198 (-51303)
organism 2 (+2)
Mus spretus 0 (-4)
Mus 0 (-18)
Homo sapiens 0 (-4513)
Mus musculus musculus 0 (-10)
Rattus norvegicus 0 (-4)
Mus musculus molossinus 0 (-14)
Pongo pygmaeus 0 (-2)
Mus musculus domesticus 0 (-15)
Bos taurus 0 (-1)
Plecturocebus moloch 0 (-1)
Saguinus labiatus 0 (-1)
Gorilla gorilla 0 (-1)
Mus musculus castaneus 0 (-4)
Other 0 (0)
Macaca mulatta 0 (-2)
Mus musculus bactrianus 0 (-6)
Drosophila melanogaster 0 (-389320)
Cricetulus griseus 0 (-1)
Mus musculus 0 (-522485)

SciGraph Queries

Gene Variant Mix-ups

Production Query

Dev Query

field count
variant 5194 (-2)

Genes

Production Query

Dev Query

field count
genes 2005487 (+8500)

Reagent Targeted Gene

Production Query

Dev Query

field count
rtg 239743 (+9726)

Gene Disease Mix-ups

Production Query

Dev Query

field count
gene 1 (+1)

Variant Loci

Production Query

Dev Query

field count
variants 884494 (+3255)

Sequence Features

Production Query

Dev Query

field count
features 7052361 (-1228094)

Genotypes

Production Query

Dev Query

field count
genotypes 44892 (-656827)

Genes in more than one taxa

Production Query

Dev Query

field count
genes 1 (+1)

Number of edges connected to owl:Nothing

Production Query

Dev Query

field count
nothing 173352 (+173352)