Solr Queries

Disease Phenotype Associations

Production Query

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species count
Homo sapiens 0 (-5)
Total 0 (-218312)
Other 0 (-218307)

Genotype Phenotype Associations

Production Query

Dev Query

species count
NCBITaxon:477815 0 (-11)
Other 0 (-10069)
Mus 0 (-12)
Mus musculus musculus 0 (-13)
Total 0 (-948690)
Mus musculus castaneus 0 (-12)
Homo sapiens 0 (-116399)
Mus spretus 0 (-1)
Danio rerio 0 (-97451)
Drosophila melanogaster 0 (-397389)
Mus musculus 0 (-327285)
Mus musculus domesticus 0 (-36)
Mus musculus bactrianus 0 (-1)
Mus musculus molossinus 0 (-11)

Gene Variant Associations

Production Query

Dev Query

species count
Total 1571525 (+13922)
Mus musculus 810446 (+1024)
Drosophila melanogaster 296627 (+2026)
Homo sapiens 256438 (+4940)
Caenorhabditis elegans 114334 (+1302)
Danio rerio 33627 (+207)
Saccharomyces cerevisiae 22299 (+4249)
Bos taurus 15406 (0)
Escherichia coli 9535 (+82)
Other 3665 (-14)
Sus scrofa 3145 (-4)
Aequorea victoria 2089 (+58)
Gallus gallus 1620 (+2)
NCBITaxon:86600 315 (+7)
Rattus norvegicus 234 (+1)
Equus caballus 183 (0)
NCBITaxon:32630 172 (+16)
Photinus pyralis 116 (0)
Anopheles gambiae 73 (0)
NCBITaxon:32644 57 (+3)
Neurospora crassa 55 (+2)
NCBITaxon:7231 49 (0)
Drosophila mauritiana 49 (0)
Chlamydomonas reinhardtii 44 (+6)
Drosophila affinidisjuncta 42 (0)
Drosophila virilis 41 (+3)
Xenopus laevis 31 (0)
Human alphaherpesvirus 1 25 (-1)
Tribolium castaneum 24 (0)
Drosophila pseudoobscura pseudoobscura 24 (+1)
Drosophila simulans 22 (0)
NCBITaxon:2389 20 (0)
Bombyx mori 18 (0)
Clostridium tetani 18 (+1)
Entacmaea quadricolor 18 (0)
Streptococcus pyogenes 17 (+1)
:.well-known/genid/bb2cf0ff025d4622cf5 16 (0)
Escherichia virus P1 16 (0)
Autographa californica nucleopolyhedrovirus 13 (0)
Corynephage beta 13 (0)
Musca domestica 13 (0)
Apis mellifera 13 (0)
Drosophila mojavensis 12 (0)
NCBITaxon:12470 12 (0)
Drosophila ananassae 12 (0)
Drosophila hawaiiensis 12 (0)
NCBITaxon:12227 11 (0)
Drosophila miranda 11 (0)
NCBITaxon:2387 11 (0)
Oryctolagus cuniculus 10 (0)
Escherichia virus MS2 9 (0)
Arabidopsis thaliana 8 (+1)
NCBITaxon:30033 8 (0)
Cupiennius salei 8 (0)
NCBITaxon:12287 8 (0)
NCBITaxon:7111 8 (+1)
Aedes aegypti 8 (0)
Kluyveromyces lactis 7 (0)
Bradyrhizobium sp. 7 (0)
NCBITaxon:496660 7 (-1)
Enterobacteria phage T7 7 (0)
Danaus plexippus 6 (0)
NCBITaxon:38358 6 (0)
Ricinus communis 6 (0)
Artemia franciscana 6 (0)
Drosophila hydei 6 (0)
Human immunodeficiency virus 1 6 (0)
Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium 6 (0)
NCBITaxon:148603 6 (0)
NCBITaxon:6136 6 (0)
:.well-known/genid/a35efa09e0fb254e16a 6 (0)
Drosophila immigrans 5 (0)
Natronomonas pharaonis 5 (0)
Drosophila grimshawi 5 (0)
Ovis aries 5 (0)
Human adenovirus 5 5 (0)
NCBITaxon:8204 5 (0)
Drosophila yakuba 5 (0)
Human mastadenovirus C 5 (0)
Bordetella pertussis 5 (0)
Scaptodrosophila lebanonensis 5 (0)
Listeria monocytogenes 5 (0)
Canis lupus familiaris 5 (0)
Drosophila willistoni 5 (0)
Macaca mulatta polyomavirus 1 5 (0)
Ceratitis capitata 5 (0)
Anopheles funestus 4 (0)
NCBITaxon:45455 4 (0)
Tomato bushy stunt virus 4 (0)
NCBITaxon:95512 4 (0)
NCBITaxon:28456 4 (+1)
Rhodococcus sp. 4 (0)
NCBITaxon:955 4 (0)
Zygosaccharomyces rouxii 4 (0)
NCBITaxon:7010 4 (0)
NCBITaxon:64279 4 (0)
Ciona intestinalis 4 (0)
:.well-known/genid/e66d689dd86a07aea60 3 (0)
Staphylococcus aureus 3 (0)
Hydra vulgaris 3 (0)
Heliothis virescens 3 (0)
:.well-known/genid/f8141fdf82ae439afe6 3 (0)
NCBITaxon:55100 3 (0)
NCBITaxon:418985 3 (0)
Culex pipiens 3 (0)
Drosophila teissieri 3 (0)
Euglena gracilis 3 (0)
NCBITaxon:4957 3 (0)
Monosiga brevicollis 3 (0)
NCBITaxon:11309 3 (0)
Vibrio cholerae 3 (0)
NCBITaxon:196280 3 (0)
Deinococcus radiodurans 3 (+1)
Toxoplasma gondii 3 (0)
Lucilia cuprina 3 (0)
NCBITaxon:46758 3 (0)
Pseudopleuronectes americanus 3 (0)
Zygosaccharomyces bailii 3 (0)
Glossina morsitans 3 (0)
Vibrio parahaemolyticus 3 (0)
Bacillus subtilis 3 (0)
NCBITaxon:80765 3 (0)
Bacillus anthracis 3 (0)
Bacillus halodurans 2 (0)
NCBITaxon:7740 2 (0)
NCBITaxon:88209 2 (0)
Cricket paralysis virus 2 (0)
Hadronyche versuta 2 (0)
NCBITaxon:1208342 2 (0)
NCBITaxon:82678 2 (0)
NCBITaxon:109461 2 (0)
Schistocerca americana 2 (0)
NCBITaxon:35525 2 (0)
Limulus polyphemus 2 (0)
Drosophila sechellia 2 (0)
Helicobacter pylori 2 (0)
Drosophila subobscura 2 (0)
Bungarus multicinctus 2 (+1)
Blattella germanica 2 (0)
NCBITaxon:62873 2 (0)
Amphimedon queenslandica 2 (0)
Schistosoma japonicum 2 (0)
Trichoplax adhaerens 2 (0)
Mesocricetus auratus 2 (0)
Campoletis sonorensis ichnovirus 2 (0)
NCBITaxon:5530 2 (0)
Providencia stuartii 2 (+1)
Clavularia sp. 2 (0)
NCBITaxon:7038 2 (0)
NCBITaxon:103846 2 (0)
Acyrthosiphon pisum 2 (0)
Sindbis virus 2 (0)
NCBITaxon:45264 2 (0)
Human betaherpesvirus 5 2 (0)
Aeromonas salmonicida 2 (0)
Drosophila persimilis 2 (0)
Oryza sativa 2 (+2)
NCBITaxon:7119 2 (0)
Triticum aestivum 2 (0)
Human papillomavirus type 18 2 (+2)
Rhodopseudomonas palustris 2 (0)
Nodamura virus 1 (0)
Human T-lymphotropic virus 1 1 (0)
Pan troglodytes 1 (0)
NCBITaxon:7120 1 (0)
NCBITaxon:703 1 (0)
Cucurbit aphid-borne yellows virus 1 (0)
Megaselia scalaris 1 (0)
NCBITaxon:47314 1 (0)
NCBITaxon:210840 1 (0)
:.well-known/genid/3ac34b5428d3d051863 1 (0)
Vaccinia virus 1 (0)
Potato virus X 1 (0)
Human T-lymphotropic virus 2 1 (0)
Spodoptera frugiperda ascovirus 1a 1 (0)
:.well-known/genid/1f58a0779e93c2ed4d2 1 (0)
NCBITaxon:191210 1 (0)
NCBITaxon:1649241 1 (0)
Cricetulus griseus 1 (0)
Arachis hypogaea 1 (0)
NCBITaxon:32392 1 (0)
NCBITaxon:7007 1 (0)
Streptomyces hygroscopicus 1 (0)
NCBITaxon:55084 1 (0)
NCBITaxon:191766 1 (0)
NCBITaxon:1051066 1 (0)
NCBITaxon:46745 1 (0)
NCBITaxon:161601 1 (0)
NCBITaxon:95109 1 (0)
NCBITaxon:118641 1 (+1)
NCBITaxon:12232 1 (0)
Ixodes scapularis 1 (0)
Drosophila orena 1 (0)
NCBITaxon:2014434 1 (+1)
Saccharomyces cerevisiae S288C 1 (0)
NCBITaxon:56459 1 (0)
Halocynthia roretzi 1 (0)
Fenneropenaeus merguiensis 1 (0)
NCBITaxon:11913 1 (0)
Manduca sexta 1 (0)
Pediculus humanus 1 (0)
NCBITaxon:10456 1 (0)
Pseudomonas aeruginosa 1 (0)
Conus marmoreus 1 (0)
Enterococcus faecalis 1 (0)
NCBITaxon:35572 1 (0)
Turnip crinkle virus 1 (0)
Beet yellows virus 1 (0)
NCBITaxon:39722 1 (0)
Armoracia rusticana 1 (0)
Peanut clump virus 1 (0)
Hemitripterus americanus 1 (0)
NCBITaxon:301887 1 (0)
Brevundimonas diminuta 1 (0)
NCBITaxon:7300 1 (0)
NCBITaxon:303354 0 (-1)

Variant Genotype Associations

Production Query

Dev Query

species count
Total 1072458 (+19555)
Mus musculus 526426 (+3941)
Drosophila melanogaster 404236 (+14916)
Danio rerio 137198 (+697)
Homo sapiens 4514 (+1)
Mus 18 (0)
Mus musculus domesticus 15 (0)
Mus musculus molossinus 14 (0)
Mus musculus musculus 10 (0)
Mus musculus bactrianus 6 (0)
Rattus norvegicus 4 (0)
Mus musculus castaneus 4 (0)
Mus spretus 4 (0)
Pongo pygmaeus 2 (0)
Macaca mulatta 2 (0)
Plecturocebus moloch 1 (0)
Saguinus labiatus 1 (0)
Gorilla gorilla 1 (0)
Bos taurus 1 (0)
Cricetulus griseus 1 (0)
Other 0 (0)

Variant Disease Associations

Production Query

Dev Query

species count
Total 82833 (+1762)
Homo sapiens 82094 (+1762)
Other 739 (0)

Gene Disease Associations

Production Query

Dev Query

species count
Total 34955 (+279)
Homo sapiens 33970 (+273)
Canis lupus familiaris 234 (0)
Mus musculus 169 (+4)
Bos taurus 119 (0)
Felis catus 61 (0)
Ovis aries 47 (0)
Sus scrofa 42 (0)
Gallus gallus 41 (0)
Equus caballus 41 (0)
Drosophila melanogaster 32 (0)
Rattus norvegicus 28 (+2)
Danio rerio 16 (0)
Capra hircus 15 (0)
Oryctolagus cuniculus 12 (0)
Coturnix japonica 9 (0)
Equus asinus 5 (0)
Neovison vison 5 (0)
Other 5 (0)
Oryzias latipes 4 (0)
Bubalus bubalis 4 (0)
Mesocricetus auratus 4 (0)
Caenorhabditis elegans 4 (0)
Macaca mulatta 3 (0)
Vulpes lagopus 3 (0)
NCBITaxon:198806 3 (0)
Bos grunniens 3 (0)
Vulpes vulpes 2 (0)
Mustela putorius furo 2 (0)
Mammuthus primigenius 2 (0)
Meleagris gallopavo 2 (0)
NCBITaxon:32536 2 (0)
Macaca fascicularis 2 (0)
NCBITaxon:48883 2 (0)
Peromyscus maniculatus 1 (0)
NCBITaxon:9773 1 (0)
Sciurus carolinensis 1 (0)
NCBITaxon:120794 1 (0)
Elephas maximus 1 (0)
NCBITaxon:61386 1 (0)
Coturnix coturnix 1 (0)
Sus scrofa domesticus 1 (0)
Bos mutus 1 (0)
NCBITaxon:38666 1 (0)
Balaenoptera acutorostrata 1 (0)
NCBITaxon:118797 1 (0)
Canis latrans 1 (0)
Phoenicopterus ruber 1 (0)
NCBITaxon:328808 1 (0)
Rangifer tarandus 1 (0)
NCBITaxon:103584 1 (0)
Symphalangus syndactylus 1 (0)
Camelus dromedarius 1 (0)
NCBITaxon:68352 1 (0)
NCBITaxon:61455 1 (0)
NCBITaxon:345164 1 (0)
NCBITaxon:46844 1 (0)
Panthera tigris 1 (0)
NCBITaxon:9691 1 (0)
Delphinapterus leucas 1 (0)
Macaca fuscata 1 (0)
Astyanax 1 (0)
NCBITaxon:57661 1 (0)
NCBITaxon:57662 1 (0)
Cavia porcellus 1 (0)
NCBITaxon:34892 1 (0)
NCBITaxon:43597 1 (0)
Dromaius novaehollandiae 1 (0)
NCBITaxon:61406 1 (0)
NCBITaxon:9690 1 (0)
NCBITaxon:338458 1 (0)
Oreochromis niloticus 1 (0)
Ursus americanus 1 (0)
NCBITaxon:273489 1 (0)
NCBITaxon:37029 1 (0)
Ctenopharyngodon idella 1 (0)
NCBITaxon:8523 1 (0)
Anas platyrhynchos 1 (0)
NCBITaxon:61402 1 (0)
Gorilla gorilla 1 (0)
Cebus apella 1 (0)
NCBITaxon:87177 1 (0)
Columba livia 1 (0)
NCBITaxon:54059 1 (0)
Numida meleagris 1 (0)
Panthera tigris tigris 1 (0)
Aepyceros melampus 1 (0)
Canis lupus 1 (0)
NCBITaxon:70340 1 (0)
Takifugu rubripes 1 (0)
NCBITaxon:9579 1 (0)
Peromyscus polionotus 1 (0)
NCBITaxon:255217 1 (0)
Hylobates lar 1 (0)
Tursiops truncatus 1 (0)
Pan troglodytes 1 (0)

Gene Phenotype Associations

Production Query

Dev Query

species count
NCBITaxon:43597 0 (-1)
Mammuthus primigenius 0 (-1)
Sciurus carolinensis 0 (-1)
NCBITaxon:9690 0 (-1)
Vulpes vulpes 0 (-2)
Danio rerio 0 (-54338)
Caenorhabditis elegans 0 (-52540)
Ursus americanus 0 (-1)
Mus musculus 0 (-214810)
Bos grunniens 0 (-1)
Equus caballus 0 (-63)
Gallus gallus 0 (-294)
Meleagris gallopavo 0 (-3)
Capra hircus 0 (-18)
Escherichia coli 0 (-1)
Phoenicopterus ruber 0 (-17)
Homo sapiens 0 (-172174)
Total 0 (-793525)
Sus scrofa 0 (-784)
Peromyscus polionotus 0 (-1)
Drosophila melanogaster 0 (-215545)
NCBITaxon:61402 0 (-1)
Canis lupus familiaris 0 (-478)
Saccharomyces cerevisiae S288C 0 (-68224)
NCBITaxon:68352 0 (-1)
Mustela putorius furo 0 (-10)
NCBITaxon:87177 0 (-1)
Oryzias latipes 0 (-4)
Bubalus bubalis 0 (-2)
Numida meleagris 0 (-1)
Oryctolagus cuniculus 0 (-10)
NCBITaxon:32536 0 (-1)
NCBITaxon:2387 0 (-1)
Panthera tigris tigris 0 (-1)
NCBITaxon:38666 0 (-1)
NCBITaxon:70340 0 (-1)
Rattus norvegicus 0 (-1236)
Other 0 (-6505)
Vulpes lagopus 0 (-1)
Coturnix japonica 0 (-1)
Felis catus 0 (-125)
Saccharomyces cerevisiae 0 (-49)
Neovison vison 0 (-4)
Mesocricetus auratus 0 (-3)
Ovis aries 0 (-57)
Macaca mulatta 0 (-4)
Bos taurus 0 (-6207)

Variant Phenotype Associations

Production Query

Dev Query

species count
Gallus gallus 0 (-5754)
Other 0 (-556211)
Mus musculus 0 (-350125)
Equus caballus 0 (-452)
Oncorhynchus mykiss 0 (-122)
Ovis aries 0 (-1157)
Escherichia coli 0 (-1)
Saccharomyces cerevisiae 0 (-67)
Homo sapiens 0 (-2653474)
Total 0 (-3897136)
Sus scrofa 0 (-12703)
Bos taurus 0 (-89463)
Caenorhabditis elegans 0 (-89349)
Drosophila melanogaster 0 (-50360)
NCBITaxon:2387 0 (-3)
Saccharomyces cerevisiae S288C 0 (-23)
Danio rerio 0 (-87872)

Model Disease Associations

Production Query

Dev Query

species count
Total 25138 (-224)
Homo sapiens 11808 (+26)
Mus musculus 7418 (+11)
Caenorhabditis 1542 (-60)
Caenorhabditis elegans 1301 (-32)
Diptera 999 (+88)
Mammalia 737 (-233)
Danio rerio 717 (+17)
Drosophila melanogaster 606 (-41)
Aves 3 (0)
Bos taurus 3 (0)
Other 2 (0)
Viridiplantae 1 (0)
Mus musculus castaneus 1 (0)

Relations

Production Query

Dev Query

relation count
Total 31013867 (-6489129)
is_about 6929288 (+19635)
mentions 5589789 (+90127)
interacts with 3624289 (-8783)
Other 2070105 (-1177233)
Source 2066740 (-190401)
in paralogy relationship with 2047525 (-39418)
in orthology relationship with 1570786 (-12663)
expressed in 1453393 (+352)
in 1 to 1 orthology relationship with 1346984 (-2463)
involved in 1182413 (+254208)
is_allele_of 856347 (+1254)
has_genotype 465964 (+9574)
is part of 348794 (+153518)
enables 318529 (+139247)
has_affected_feature 243837 (+1671)
is_expression_variant_of 187380 (-7795)
targets_gene 172858 (+824)
in xenology relationship with 146834 (+142)
sequence_derives_from 111098 (+17968)
colocalizes with 75189 (+76)
pathogenic_for_condition 50498 (+1032)
is model of 36265 (-199)
contributes to 32991 (-3382)
derives_from 29597 (+32)
genetically interacts with 20375 (+6)
is marker for 14016 (-196743)
likely_pathogenic_for_condition 12084 (+536)
has phenotype 9894 (-5540241)
is_reference_allele_of 4 (0)
is_variant_allele_of 1 (0)
disease has basis in feature 0 (-10)

SciGraph Queries

Reagent Targeted Gene

Production Query

Dev Query

field count
rtg 240283 (+10266)

Genes

Production Query

Dev Query

field count
genes 1998258 (+1271)

Genotypes

Production Query

Dev Query

field count
genotypes 716448 (+14729)

Gene Disease Mix-ups

Production Query

Dev Query

field count
gene 0 (0)

Gene Variant Mix-ups

Production Query

Dev Query

field count
variant 5202 (+6)

Genes in more than one taxa

Production Query

Dev Query

field count
genes 0 (0)

Variant Loci

Production Query

Dev Query

field count
variants 882228 (+989)

Sequence Features

Production Query

Dev Query

field count
features 8337953 (+57498)

Number of edges connected to owl:Nothing

Production Query

Dev Query

field count
nothing 0 (0)